4sale.

Uno strumento per la sequenza di RNA sincrona e l'allineamento della struttura secondaria e la modifica
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4sale. Classifica e riepilogo

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4sale. Descrizione

Nell'analisi della sequenza l'allineamento multiplo costruisce il fondamento di tutte le analisi dei procedimenti. Gli errori in un allineamento potrebbero influenzare fortemente tutte le analisi successive e quindi potrebbero portare a previsioni errate. Sono necessari allineamenti artigianali e migliorati a mano e nel frattempo una buona pratica comune. Per le sequenze di RNA spesso la sequenza primaria e un consenso della struttura secondario è ben noto, ad esempio la struttura quadrifoglio del T-RNA. Di recente, alcuni editori di allineamento sono proposti che sono in grado di includere e modellare entrambi i tipi di informazioni. Tuttavia, con l'avvento di una grande quantità di sequenze di RNA affidabili insieme alle loro strutture secondarie risolte (disponibili da E.G. Il database IT2), siamo di fronte al problema per gestire sequenze e le loro strutture secondarie associate in modo sincrono. 4Sale riempie questo divario. L'applicazione è stata sviluppata per consentire una sequenza rapida e un'allineamento della struttura secondaria sincrona per set di dati di grandi dimensioni e per la prima volta la modifica manuale sincrona delle sequenze allineate e le loro strutture secondarie. Questo studio descrive un algoritmo per l'allineamento sincrono delle sequenze e le loro strutture secondarie associate e le caratteristiche principali di 4Sale utilizzate per ulteriori analisi e modifica. 4Sale costruisce un punto di partenza ottimale e unico per ogni sequenza di RNA e analisi della struttura. 4Sale, che fornisce un'interfaccia user-friendly e intuitiva, è una casella degli strumenti completa per l'analisi dell'RNA basata su sequenza e informazioni sulla struttura secondaria.


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