Tracciante

Tracer - APP GRATUITA per analizzare i file di traccia generati da Guns McMC Bayesian
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Tracciante Classifica e riepilogo

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  • Rating:
  • Licenza:
  • Freeware
  • Prezzo:
  • FREE
  • Nome editore:
  • Andrew Rambaut
  • Sito web dell'editore:
  • http://tree.bio.ed.ac.uk/software/seal/
  • Sistemi operativi:
  • Mac OS X
  • Dimensione del file:
  • 3.5 MB

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Tracciante Descrizione

Tracer - APP GRATUITA per analizzare i file di traccia generati da bayesian mcmc runs Tracer è un'app gratuita per analizzare i file di traccia generati da bayesian mcmc runs (cioè i valori dei parametri continui campionati dalla catena). Può essere utilizzato per analizzare le esecuzioni di MRBAYES, Lamarc, Bestia e possibilmente altri programmi MCMC. Ci sono 4 schede di analisi tra cui scegliere: · Stime - questo mostra la media, STDEV, intervalli di confidenza e altre statistiche sul parametro selezionato. Verrà anche tracciata una distribuzione della frequenza. · Densità - Questo mostra il grafico della densità del posteriore bayesiano per il parametro selezionato. · Joint-Marginal: appare solo se esattamente 2 parametri sono scelti (tenere premuto SHIFT per selezionare più parametri). Quindi tramonta uno contro l'altro a guardare la loro distribuzione marginale congiunta. · Traccia: mostra la traccia del parametro contro il numero di stato o di generazione. Utilizzare questo per controllare la miscelazione, scegli un ustione adatto e cerca le tendenze che potrebbero suggerire problemi con convergenza.requirementi: · Java 1.5 o successivi


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