| Tracciante Tracer - APP GRATUITA per analizzare i file di traccia generati da Guns McMC Bayesian |
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Tracciante Classifica e riepilogo
- Nome editore:
- Andrew Rambaut
- Sito web dell'editore:
- http://tree.bio.ed.ac.uk/software/seal/
- Sistemi operativi:
- Mac OS X
- Dimensione del file:
- 3.5 MB
Tracciante Tag
Tracciante Descrizione
Tracer - APP GRATUITA per analizzare i file di traccia generati da bayesian mcmc runs Tracer è un'app gratuita per analizzare i file di traccia generati da bayesian mcmc runs (cioè i valori dei parametri continui campionati dalla catena). Può essere utilizzato per analizzare le esecuzioni di MRBAYES, Lamarc, Bestia e possibilmente altri programmi MCMC. Ci sono 4 schede di analisi tra cui scegliere: · Stime - questo mostra la media, STDEV, intervalli di confidenza e altre statistiche sul parametro selezionato. Verrà anche tracciata una distribuzione della frequenza. · Densità - Questo mostra il grafico della densità del posteriore bayesiano per il parametro selezionato. · Joint-Marginal: appare solo se esattamente 2 parametri sono scelti (tenere premuto SHIFT per selezionare più parametri). Quindi tramonta uno contro l'altro a guardare la loro distribuzione marginale congiunta. · Traccia: mostra la traccia del parametro contro il numero di stato o di generazione. Utilizzare questo per controllare la miscelazione, scegli un ustione adatto e cerca le tendenze che potrebbero suggerire problemi con convergenza.requirementi: · Java 1.5 o successivi
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