Sequenza annotata con GFF

Annotare una sequenza con annotazioni da un file GFF.
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Sequenza annotata con GFF Classifica e riepilogo

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  • CLC bio
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Sequenza annotata con GFF Tag


Sequenza annotata con GFF Descrizione

La sequenza di annotata con GFF è un plug-in che consente di annotare una sequenza con annotazioni da un file GFF (formato funzione generico) nel Workbench CLC o nel server CLC. Un file GFF non contiene informazioni di sequenza, contiene solo un elenco di annotazioni. Puoi leggere di più sul formato su http://www.sanger.ac.uk/software/formats/gff. È inoltre possibile utilizzare i file GTF (Gene Trasfer Format). Questo formato è utilizzato tra gli altri il browser del genoma UCSC all'indirizzo http://genome.ucsc.edu. Se scarica una traccia di annotazione (E.G. SNPS, Ripeti) Puoi ottenere questo come file GTF.Nota! I file GTF scaricati dal browser del genoma UCSC non sono compatibili con l'analisi RNA-Seq di CLC Genomics Workbench perché le annotazioni del gene e della trascrizione non possono essere abbinate.Nota: la sequenza di annotata con il software GFF è solo a scopo di ricerca.


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