SCHERZO Metodo di allineamento della sequenza progressiva del Philogeny-Aware
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SCHERZO Classifica e riepilogo

SCHERZO Tag

Probabilistico. dna. Sequenza del DNA

SCHERZO Descrizione

Prank è un programma di allineamento multiplo probabilistico per sequenze DNA, codon e aminoacidi. Lo scherzo si basa su un nuovo algoritmo che tratta correttamente gli inserimenti ed evita la sovralimentazione del numero di eventi di cancellazione. Oltre a questo, Prank prende in prestito le idee dei metodi di massima probabilità utilizzati nella filogenetica e tiene conto correttamente alle distanze evolutive tra le sequenze. Infine, Prank consente di definire una struttura potenziale per le sequenze da allinearsi e quindi, simultaneamente con l'allineamento, prevede le posizioni delle unità strutturali nelle sequenze.

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