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Pacchetto per la simulazione esatta stocastica dei sistemi di diffusione della reazione
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  • Rating:
  • Licenza:
  • GPL
  • Prezzo:
  • FREE
  • Nome editore:
  • STEPS Team
  • Sito web dell'editore:
  • Sistemi operativi:
  • Mac OS X
  • Dimensione del file:
  • 1.4 MB

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Passi Descrizione

Pacchetto per una simulazione esatta stocastica dei sistemi di diffusione della reazione Passaggi è un pacchetto gratuito e open source per la simulazione esatta stocastica dei sistemi di diffusione della reazione in geometrie 3D complesse arbitrariamente complesse. L'algoritmo di simulazione del nucleo è un'implementazione della SSA di Gillespie, estesa per affrontare diffusione di molecole sugli elementi di una maglia tetraedrica 3D. È stato principalmente sviluppato per simulare modelli dettagliati di percorsi di segnalazione neuronale nei Dendriti e nei dintorni di sinapsi, è anche un generale Strumento e può essere utilizzato per lo studio di qualsiasi percorso biochimico in cui si pensa che i gradienti spaziali e la morfologia svolgano un ruolo. Requisiti: · Python 2.5 o successivo


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