PAGANO

Uno strumento che fornisce un metodo per l'allineamento di sequenze multiple utilizzando i grafici di ordine parziale
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PAGANO Classifica e riepilogo

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  • Rating:
  • Licenza:
  • GPL
  • Nome editore:
  • ari.loytynoja
  • Sito web dell'editore:
  • http://code.google.com/u/116870160609494076183/
  • Sistemi operativi:
  • Mac OS X 10.7 or later
  • Dimensione del file:
  • 3.7 MB

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PAGANO Descrizione

Pagan è un metodo generico per l'allineamento dei grafici di sequenza. Il vantaggio principale della rappresentazione del grafico delle sequenze è la capacità dei grafici di descrivere l'incertezza in presenza di caratteri in determinate posizioni di sequenza. Questo è molto utile nell'allineamento progressivo filogenetico e consente di catturare le diverse proprietà degli inserimenti e delle eliminazioni quando gli allineamenti sono iterati per più sequenze. Inoltre, i grafici consentono di descrivere l'incertezza nelle sequenze di input e nella modellazione E.G. Gli errori dell'omoploymer in Roche 454 recita o rappresentano sequenze ancestrali dedotti contro le quali possono quindi essere allineate altre sequenze. Istruzioni dettagliate su come installare e utilizzare l'utilità pagana sul tuo Mac sono disponibili qui.


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