Orfprimer. OrfPrimer - Applicazione Java per il design automatico del primer
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Orfprimer. Classifica e riepilogo

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Orfprimer. Descrizione

ORFPRIMER - Applicazione Java per il design automatico del primer Orfprimer è un'applicazione Java per il design automatico del primer. Si basa sul nostro software di software rilasciato precedentemente rilasciato che legge il formato Genbank XML- e Fable-Sequence. Le sequenze di proteine vengono generalmente scaricate semplicemente specificando l'identificativo GI o il numero di adesione del target di proteine corrispondenti. ORFER Estrai il telaio di lettura aperto dalle sequenze proteiche richieste e visualizzarla.OrfPrimer calcola automaticamente i primer PCR per queste sequenze. La manipolazione di OrfPrimer è intuitiva e abbastanza semplice utilizzando le impostazioni predefinite. Inoltre fornisce molte possibilità di modificare le opzioni di calcolo prima e anche dopo il calcolo di primer, ad esempio: · Spostamento della posizione dei primer, · Cambio della temperatura di fusione desiderata, · Cambio dei siti di restrizione nelle sequenze Primer.Questo Way Orfprimer combina adattabilità e convenienza in un programma che lo rende un potente strumento software.ORFPrimer fornisce un'interfaccia del database che consente di memorizzare le sequenze recuperate in un database SQL locale. Questo database può essere impostato utilizzando gli script del pacchetto di installazione orfprimer. Al momento MySQL, Oracle e Microsoft Access sono supportati. Ciò sono alcune funzionalità chiave di "OrfPrimer": Utilizzo semplice: · OrfPrimer è quasi auto-esplicativo · L'interfaccia grafica dell'utente (GUI) è SiappyFies The Handling.Compatibilità: · OrfPrimer è stato implementato In Java · OrfPrimer è la piattaforma indipendente · OrfPrimer può essere eseguita su macchine diverse: Windows, Linux, Mac, UNIX, ... Accessibilità online: · La tecnologia di avvio Web Java consente di avviare OrfPrimer via Internet · La procedura di download esplicita e installazione non lo è necessario. Gestione dei dati: · OrfPrimer include strumenti per configurare il proprio database. · Conceptently (MySQL, Oracle e Micosoft Access) sono supportati. · In alternativa, i dati possono essere scritti in file (ad es. Formato FAST). Computazione di throughput: · OrfPrimer essere utilizzato per calcolare i primer per un massimo di migliaia di sequenze target. · Questa procedura può essere automatizzata inoltre leggendo gli obiettivi tramite i file di testo.

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