Ncl.Libreria di classe nexus gratuita e open source per il tuo Mac | |
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Ncl. Classifica e riepilogo
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- Licenza:
- GPL
- Prezzo:
- FREE
- Nome editore:
- Mark Holder and Paul O. Lewis
- Sito web dell'editore:
- Sistemi operativi:
- Mac OS X
- Dimensione del file:
- 949 KB
Ncl. Tag
Ncl. Descrizione
libero e open source libreria di classi Nexus per il vostro Mac NCL è una libreria C ++ per interpretare i file di dati creati in base al formato di file NEXUS utilizzato in evoluzione molecolare e filogenetico sistematica. Cosa c'è di nuovo in questa versione: correzioni di bug (visibile agli utenti finali): · Apertura di file in modalità binaria (non riuscendo a farlo causare problemi con la linea end-of-e altri caratteri speciali). · Indice di carattere (0-based, piuttosto che in base 1 numero) che veniva stampato in alcuni contesti in messaggi di errore · Mela g ++ - 4.2 ottimizzazione bug ha ora una soluzione alternativa · Personaggi blocchi ora respingono i file in cui il tipo di dati è il DNA, RNA, proteine o se vengono aggiunti SIMBOLI. correzioni di bug API: · Impostazione fissa di NXS_HAS_ALL_TAXA_BIT non duplicare blocchi quando lo stesso lettore viene utilizzato per leggere più di un file · Consentendo PublicNexusReader :: Aggiungi essere chiamato · Alcune modifiche specifiche di Windows per evitare gli avvisi e errori compilando in Visual Studio 2008 (VC9) · Blocco caratteri ora genera un'eccezione se non v'è alcuna matrice · NxsReader :: problema risolto BlockIsASingeltonReader · Una migliore pulizia nel lettore multiformato, quando si verifica un errore nella lettura di un file · Un altro di accesso aggiunto per NxsSimpleTree · Funzioni PublicNexusReader GetXXXBlock cambiato per tornare 0L piuttosto che aumentare un'eccezione se si richiede un blocco che è fuori campo · NCL_CONST_FUNCS macro aggiunto Aggiunte API: · Miglioramenti alla lettura PHYLIP - matchchar ora accettate (reader multiformato solo). · La lettura di un singolo albero Newick nudo (come "phyliptree" o "relaxedphyliptree" in roba reader multiformato). · CullIdenticalTaxaBlocks aggiunti () per nexusreader. Si dovrebbe chiamare questo prima di leggere un file se si desidera che tutti i blocchi taxa ripetuti per essere distrutta piuttosto che salvato · Supporto per i codici genetici e la traduzione di aminoacidi aggiunti · GetEscapedDouble e GetEscapedInt aggiunto · GetDatatypeMapForMixedType aggiunto · Funzionalità aggiuntive per eliminare i blocchi taxa identici anche se sono blocchi implicite. Questo solo sarà attivato se il codice cliente ha chiamato NxsReader :: cullIdenticalTaxaBlocks (vero). Questo corregge un problema DZ è stato vedere con la lettura più blocchi di dati · Aliasing di titoli di blocco per i blocchi abbattuti · Cambiato la manipolazione del carattere + quando un'istanza nxstoken è stato alterato da una chiamata a hyphenNotPunctuation indictate è in effecet (questo viene fatto attraverso la funzione SetLabileFlagBit). In quasi tutti i casi questa funzione viene richiamata in modo che un numero (in particolare uno writtend in notazione scientifica sarà letto come un unico token, anziché ben 4 gettoni). In rari casi, il + viene utilizzato prima l'esponente o anche davanti al numero intero. In modo che il codice cliente non ha a che fare con questi casi, il comportamento di default è stato modificato per utilizzare il hyphenNotPunctuation per indicare che nella lettura del token successivo né · Nè + dovrebbe essere trattato come la punteggiatura. codice client che desidera utilizzare il vecchio comportamento possono compilare NCL con la macro NCL_VERSION_2_STYLE_HYPHEN definito a 1
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