Le frequenze di parole di Java. Strumento per trovare frequenze di sequenze di nucleotidica
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Le frequenze di parole di Java. Classifica e riepilogo

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Le frequenze di parole di Java. Descrizione

Le frequenze di Word Java è un front-end unico, semplice e piccolo front-end a Schbath's R'mes.r'mes trova le frequenze previste ed effettive delle brevi sequenze di nucleotidica o parole, utilizzando un modello Markov per controllare gli effetti della composizione di base e delle frequenze di parole più brevi. Le occorrenze insolitamente frequenti o infrequenti di determinate parole possono indicare rilevanza biologica. Ad esempio, se la parola "taattt" si verifica molto meno frequentemente del previsto, potrebbe essere che esegue una funzione normativa o rende la sequenza vulnerabile alla mutazione, o ha qualche altra funzione biologica. È possibile determinare anche se le parole si verifichino Nelle posizioni sovrapposte insolitamente spesso o insolitamente raramente, e le frequenze previste ed effettive delle parole fornite dall'utente.

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