Koriblast. fornisce diverse interfacce utente grafiche e strumenti di analisi per visualizzare facilmente e per esplorare i risultati di esplorazione.
Scarica ora

Koriblast. Classifica e riepilogo

Koriblast. Tag

RAFFICA domanda risultato analizzare i dati Blast Engine. risultato della query

Koriblast. Descrizione

Fornisce diverse interfacce utente grafica e strumenti di analisi per visualizzare facilmente e per esplorare i risultati di esplorazione. Koriblast è un ambiente grafico affidabile dedicato al data mining di sequenza. Koriblast combina esplosioni ricerche con capacità avanzate di gestione dei dati e un'interfaccia utente grafica all'avanguardia. KoriBlast propone un programma di schemale grafico in grado di confrontare contemporaneamente più sequenze di query con più database di sequenza con più database di sequenza utilizzando una rete o un motore BLAST locale. KoriBlast offre diverse interfacce utente grafica e strumenti di analisi per visualizzare facilmente e per esplorare i risultati di esplorazione in modi significativi, facilitando l'interpretazione dei dati. Inoltre, KoriBlast è in grado di recuperare automaticamente i dati dai database NCBI Entrez, integrando preziose informazioni direttamente nei rapporti grafici BLAST. Infine, tutte le informazioni disponibili da KoriBlast possono essere interrogabili che consentono di individuare rapidamente le informazioni pertinenti riducendo al contempo la quantità di dati all'analisi. Nota: per scaricare e ricevere una chiave di licenza che ti consentirà di eseguire l'applicazione è necessario registrarsi. Ecco alcune caratteristiche chiave di "KoriBlast": · Un software grafico amichevole e facile da imparare. · Un blast Scheduler per eseguire la ricerca con più sequenze di query su più database contemporaneamente allo stesso tempo. · Le query esplosive vengono eseguite utilizzando il server NCBI BLAST o un'installazione locale di BLAST. · Strumenti di analisi grafica intelligenti integrati che forniscono un sistema minerario di esplosione molto efficiente. · Importare dati aggiuntivi (funzionalità conosciute dei successi) da un accesso diretto e trasparente alle fonti di dati biologici. · I dati importati sono: integrati all'interno dei risultati BLAST, visualizzati all'interno dei report grafici, disponibili per filtrare i risultati di esplosioni. · Individuare le informazioni pertinenti utilizzando i filtri. · Ridurre la quantità di dati da analizzare utilizzando i filtri. · I dati memorizzati sull'unità disco dell'utente rimangono disponibili nel tempo. · Esportare i dati sulle applicazioni del foglio di calcolo. · Recuperare sequenze di successo complete dai database di sequenza remota. · Esportare sequenze di successo complete per FASTA file. · Ri-esplosione precedenti query esplosioni con un singolo clic del mouse. · Ripensa sequenze di successo complete con un singolo clic del mouse. · Visualizzare le voci di successo complete utilizzando il tuo browser Web preferito. Requisiti: · PowerPC (G3 o nuovo) o processore Intel Pentium. · Una macchina virtuale Java (JVM) 1.5.0 o superiore. · Almeno 128 mesi di RAM (raccomandato 256 mesi). · Una risoluzione dello schermo di 1024 da 728 pixel. Limitazioni: · Periodo di prova di 14 giorni. Cosa c'è di nuovo in questa versione: · Le ricerche PSI-BLAST sono disponibili dal modulo di ricerca e il modulo analizza è stato adattato per abilitare l'analisi estesa dei risultati (vedere la figura seguente e visualizzare questo video). · Preparare le banche dati personali di Blast da Genbank nativo, Genpipt, Embl, Swissprot e UniProt Files, utilizzando file di testo normale o file compressi con gzitted (visualizzare questo video). · Installare le banche dati preformattate NCBI BLAST direttamente dai loro file "tar.gz" nativi (visualizza questo video). · Design Search Filtri Abilitando il modello corrispondente alle sequenze di successo. · Confronta i risultati di ricerca per trovare hit nuovi, comuni o cancellati. · Esportare file di dati koriblast e filtri per condividere con i colleghi con Koriblast o Blastviewer. · Nuovo visualizzatore di sequenza per visualizzare e manipolare sequenze (estratto, tradurre, ottenere composizioni) scaricate dai repository pubblici (vedi figura sotto). · Migliore gestione di grandi progetti che coinvolgono migliaia di sequenze.

Koriblast. Software correlato