 | GreylagSoftware per l'identificazione del peptide di spettro di massa tandem |
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Greylag Classifica e riepilogo
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- Licenza:
- GPL
- Prezzo:
- FREE
- Nome editore:
- Mike Coleman
- Sito web dell'editore:
- Sistemi operativi:
- Mac OS X
- Dimensione del file:
- 120 KB
Greylag Tag
Greylag Descrizione
Software per l'identificazione del peptide di spettro di massa tandem Software di identificazione e convalida del peptide spettrale di massa tandem, simile a X! Tandem, Omssa, Myrimatch. Greylag è adatto per host singoli attraverso grandi cluster.Greylag è scritto in Python per semplicità, con sezioni critiche per prestazioni in C ++. Requisiti: · Python. Cosa c'è di nuovo in questa versione: · Nuovo programma `GREYLAG-REANNOTATE" ha un set di file SQT e un FASTA · Database e riannita i peptidi trovati come se la ricerca fosse stata eseguita · Contro il database specificato. (Di solito è molto più veloce del rifare · la ricerca.) · Questo comando funzionerà sui file SQT prodotti da Greylag o Sequest e · Corregge alcuni problemi di troncamento in loci generati da quest'ultimo. Inoltre · Produce meglio residui di fianco e gestisce i residui isobarica di più · Correttamente. · `` "Greylag-convalidate --prefer-cliner-mass" ha un alias di carica migliore · gestione. · `` Maximum_missed_cleavage_sites` è il valore predefinito a 1. · I caratteri di ritorno del carrello nei file MS2 sono ora gestiti meglio.
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