Classificatore RDP. Naive Bayesian classificatore che può richiedere rapidamente e accuratamente incarichi tassonomici dal dominio al genere
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Classificatore RDP. Classifica e riepilogo

Classificatore RDP. Tag

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Classificatore RDP. Descrizione

Naive Bayesian classificatore che può rapidamente e accuratamente fornisce incarichi tassonomici dal dominio al genere Il classificatore RDP è un classico naive Bayesian sviluppato per fornire un rapido posizionamento tassonomico basato sui dati della sequenza di RRNA. Il classificatore RDP può classificare rapidamente e accuratamente le sequenze batteriche di RRNA nella nuova tassonomia di ordine superiore proposto da Bergey's Trust. Fornisce incarichi tassonomici dal dominio al genere, con stime di fiducia per ciascun incarico. Il classificatore RDP non è limitato all'utilizzo della tassonomia batterica proposta dagli editori Bergey. Ha funzionato ugualmente bene se addestrato sulla tassonomia NCBI. Il classificatore del RDP può essere adattato a ulteriori tassonomie batteriche filogeneticamente coerenti. La classificatore RDP ti consentirà di assegnare facilmente alle sequenze di gene dei 16s RRNA alla nuova tassonomia batterica più elevata in ordine superiore filogeneticamente coerente proposto da Garrity Et. Al.Hierarchica taxa si basa su un classificatore Nive Bayesian RRNA. Il classico di nuova formazione consente la classificazione delle sequenze batteriche e archeee 16s RRNA. Cosa c'è di nuovo in questa versione: · La versione precedente classificherebbe le sequenze senza parole valide. · Modificato per richiedere nuove variabili min_good_words e impostarlo per essere min_seq_len - sequence.wordsize.

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