| Abacas. Continuazione automatica basata sull'algoritmica delle sequenze di fucili da caccia assemblate |
Scarica ora |
Abacas. Classifica e riepilogo
- Nome editore:
- Sammy Assefa
- Sistemi operativi:
- Mac OS X
- Dimensione del file:
- 59 KB
Abacas. Tag
Abacas. Descrizione
Continuazione automatica a base di algoritmica delle sequenze di fucili da caccia assemblate Abacas destinati a contigiane rapidamente (allineare, ordinare, orientare), progettare e visualizzare i primer a chiudere gli spazi vuoti sugli contigli assemblati da Shotgun basati su una sequenza di riferimento.Abacas utilizza Mummer per trovare le posizioni di allineamento e identificare le sintetie dei contigli assemblati contro il riferimento. Viene quindi elaborato per generare una pseudomolecule prendendo contigruppi di sovrapposizione e lacune in contatto. Abacas genera un file di confronto che può essere utilizzato per visualizzare contigs ordinato e orientato a ARTEMIS Act. La sintonia è rappresentata da barre rosse in cui l'intensità del colore diminuisce con valori inferiori dell'identità percentuale tra blocchi comparabili. Le informazioni sui contigli come l'orientamento, l'identità percentuale, la copertura e la sovrapposizione con altri contigs possono anche essere visualizzate caricando il file delle funzionalità output in atto. Requisiti: · Mummer. · Atto di Artemis (opzionale) Cosa c'è di nuovo in questa versione: · Questa è l'ultima versione di Abacas.
Abacas. Software correlato