PANAMA Un nuovo modello probabilistico per tenere conto dei fattori confondenti negli studi EQTL
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Panama è un nuovo modello probabilistico per tenere conto dei fattori confondenti negli studi di EQTL, scritti in Python. I fattori confondenti volontari, come i covariati non inosservati o le perturbazioni ambientali sconosciute, le perturbazioni ambientali possono creare false associazioni spurie o mascherare segnali di associazione genetica reale. In contrasto con i metodi precedenti, Panama apprende i fattori nascosti congiuntamente con l'effetto di prominenti regolatori genetici. Di conseguenza, questo nuovo modello può distinguere più accuratamente i veri segnali di associazione genetica da variazione confondente .n. Fusi, o. Stegle e N. D. Lawrence, "la modellazione congiunta dei fattori confondenti e le spinque regolatori genetici forniscono una maggiore precisione negli studi genetici di genomica", Biologia computazionale PLOS, le informazioni di informazione 2012 su http://ml.sheffield.ac.uk/qtl/panama.htmlproduct's Homepage

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