Neuronvisio. Un'interfaccia utente per Neuron Simulator Environment
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Neuronvisio. Classifica e riepilogo

Neuronvisio. Tag

visualizzazione fine frontale Visualizzazione 3D NEURON GUI Ambiente del simulatore NEURONE

Neuronvisio. Descrizione

Un'interfaccia utente per Neuron Simulator Environment Neuronvisio si collega con il neurone utilizzando la nuova interfaccia del neurone Python.Installation: per installare Neuronvisio è necessario soddisfare le seguenti dipendenze * PYGTK * Visual * MatPlotLibisy InstallIl modo per ottenere il modo più semplice per ottenere Neuronvisio è se hai installato: Easy_install neuronvisiwout setuptools, è ancora piuttosto facile . Scarica il file neuronvisio.tgz dalla pagina di cheeseshop di Neuronvisio, latar IT e RUN: Python Setup.py InstallDocumentation La documentazione è disponibile nella cartella DOC o online. Il codice online è solo per dare un'idea in modo da utilizzare NRNVisio Module: 1. Accendi una console IppyThon con switch Pylab.: Ippython -Pylab # Se non si utilizza l'interruttore non verrà visualizzato alcun grafico.2. Importa il modulo: da Neuronvisio.controls Controlli di importazione Controlli = Controlli () Quando NRNVisio viene avviato il thread viene lanciato. In questo thread tutto il processo di NRNVisio accadrà senza bloccare la console.A un rapido esempio il seguente codice: 1. Crea una singola sezione chiamata SOMA 2. Inserire un canale Hodger-Huxley e una conduttanza passiva 3. Inserire un alfasynapse per fornire Uno stimolo. Un esempio rapido può essere il seguente: da NRNVisiio.Controls Import ControlControls = Controls () # Avvio del guavolimento Neuron Import H # Ottenere l'hocinterpretetersoma = h.section () # Creazione di una sezione) .Insert ('HH') # Inserimento di un hh canalsoma.insert ('Pas') # inserimento di una conduction passivayn = h.alphasynapse (0.5, sec = soma) # synaptic inputsyn.set = 0,5 # quando a firesyn.gmax = 0,05 # la conduttanza della sinapsyn. E = 0 # L'esempio di potenziale di inversione Esempio nella directory di esempio mostra come utilizzare Neuronvisio con un modello più complesso. Ecco alcune caratteristiche chiave di "neuronvisio": · Visualizzazione 3D del modello con la possibilità di cambiarlo runtime · Creazione di vettori per registrare qualsiasi variabile presente nella sezione · Integrazione pylab per tracciare direttamente il risultato della simulazione · Esplorazione del Timecourse di qualsiasi variabile tra il tempo utilizzando una scala codificata a colori · La GUI funziona nel suo thread, quindi è possibile utilizzare la console (fortemente suggerita Ippython) Requisiti: · Python.

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