Ghemical. Ghemical è un pacchetto di modellazione molecolare con gli strumenti GUI e 3D-visualizzazione.
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Ghemical. Classifica e riepilogo

Ghemical. Tag

modellazione molecolare Modellazione molecolare Pacchetto di modellazione Ghemical.

Ghemical. Descrizione

Ghemical è un pacchetto di modellazione molecolare con strumenti GUI e 3D-visualizzazione. Ghemical è un pacchetto software di chimica computazionale rilasciato sotto GNU GPL. Significa che il codice fonte completo del pacchetto è disponibile e gli utenti sono liberi di studiare e modificare il pacchetto. Ghemical è scritto in C ++. Ghemical Project ha un'interfaccia grafica utente (che si basa su GNOME), e supporta sia i modelli di meccanica quantistica (semi-empirica che Ab Initio) e modelli di meccanica molecolare (c'è un trips sperimentale 5.2 Il campo Forza per molecu organico anche uno strumento per i modelli di proteine ridotti è incluso. L'ottimizzazione della geometria, la dinamica molecolare e un ampio set di strumenti di visualizzazione sono attualmente disponibili.GHemical si affida al codice esterno per fornire i calcoli meccanici quantistici. Semi-empirico Metodi MNDO, Mindo / 3, AM1 e PM3 provengono dal pacchetto MOPAC7 (Public Domain) e sono inclusi nella distribuzione sorgente. Il pacchetto MPQC (GNU GPL) viene utilizzato per fornire metodi AB Initio: i metodi basati su Hartree-Fock La teoria è attualmente supportata con set di base che vanno da STO-3G a 6-31G **. Il codice MPQC non è incluso nella distribuzione sorgente. Per utilizzare i metodi AB Initio basati su MPQC in Ghemical, è necessario prima compilare e installare il Programma MPQC per il tuo sistema, quindi compilare Ghemical utilizzando alcune impostazioni specifiche che collegano insieme i programmi; Vedere il file di installazione per ulteriori informazioni. Ghemical contiene anche il pacchetto OpenBabel per l'importazione ed esportazione di molti formati di file diversi (così come altre attività) .installationonce hai scaricato l'ultima versione, è necessario estrarre tutti i file dal file di archivio utilizzando "Tar -zxvvf ghemical-1.00.tgz "o equivalentemente" Gunzip Ghemical-1.00.tgz; tar -xvvf ghemical-1.00.tar ". Dopodiché si prega di leggere la "installazione" -file appena stata estratta per ottenere informazioni aggiuntive. Che è nuovo nuovo in questa versione: · Ghemical ora si sta dirigendo verso una nuova versione stabile. · La versione corrente è la versione consigliata per l'uso di "produzione". Non è una versione ufficiale stabile a causa della nuova porta Win32, che ha ancora bisogno di alcuni tocchi di finitura prima che tutto funzioni.

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