Bio :: Grafica :: FeatureFile BIO :: Grafica :: FeatureFile è un set di BIO :: Caratteristiche grafiche, memorizzate in un file.
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Bio :: Grafica :: FeatureFile Descrizione

BIO :: Grafica :: FeatureFile è un set di BIO :: Funzioni grafiche, memorizzate in un file. BIO :: Grafica :: FeatureFile è un set di Bio :: Caratteristiche grafiche, memorizzate in un file.synopsis utilizzano Bio :: Graphics :: FeatureFile; My $ Data = BIO :: Grafica :: FeatureFile-> Nuovo (-File => 'Caratteristiche.txt'); # Crea un nuovo pannello e rendering Contenuto del file su di esso My $ Panel = $ Data-> New_panel; My $ Tracks_Rendered = $ Data-> Rendering ($ Panel); # o fai tutto in un unico passaggio My ($ Tracks_Rendered, $ Panel) = $ Data-> Rendering; # Per ulteriori controllo, rendering tracce singolarmente My @Feature_Types = $ Data-> Tipi; per il mio tipo $ (@Feature_Types) {My $ Funzioni = $ Data-> Caratteristiche ($ tipo); My% options = $ Data-> Style ($ tipo); $ Panel-> add_track ($ Funzionalità, Opzioni%); # Supponendo che abbiamo un BIO :: Grafica :: Panel} # Ottieni impostazioni individuali My $ EST_FG_COLOR = $ Data-> Impostazione (EST => 'FGCOLOR'); # o creare la featureFile a mano # Aggiungi un tipo $ dati-> add_type (est => {fgcolor => 'blu', altezza => 12}); # Aggiungi una funzione My $ Funzione = BIO :: Grafica :: Funzione-> Nuova (# parametri); # o alcuni altri dati di SEQI $-> add_feature ($ feature => 'est'); il modulo Bio :: Graphics :: FeatureFile Module legge e Parses Files che descrivono le caratteristiche di sequenza e i loro rendering. Accetta sia il formato GFF che un formato di file più amichevole umano descritto di seguito. Una volta che un oggetto fetoreFile è stato inizializzato, è possibile interrogarlo per le sue caratteristiche costante e le loro impostazioni o rendering dell'intero file su A Bio :: Graphics :: Panel.Questa Moduel è un precursore del BIO di Jason Stajich :: Annotazione :: Collezione classe, e soddisfa una funzione simile di memorizzare una raccolta di funzioni di sequenza. Tuttavia, memorizza anche le informazioni di rendering sulle funzionalità e attualmente non seguono l'interfaccia Counta. Requisiti: · Perl.

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